为了加强实验仪器设备的管理，提高设备的完好率，学校制定了完备的管理规章制度，先后出台了《南通大学仪器设备管理暂行办法》、《南通大学大型贵重设备管理实施细则（试行）》、《南通大学仪器设备维修管理实施细则（试行）》、《南通大学仪器设备报废、报损管理实施细则（试行）》等相关文件。中心参照学校的各项规章制度，制定了相应的具体实施措施，设置专职仪器维修人员及资产管理员各1人，分别负责仪器的维修与管理，做到小修不出室、中修不出校，仪器设备随坏随修，保证设备完好率达98%以上。实验仪器设备的验收、注册、调剂、报废等工作由资产管理员负责。设备的使用能够做到集中管理、统一调配，保障了实验教学的正常进行。

固定资产账物相符率达100%。仪器设备平均年更新率为：机电类 5%，电子仪器7.8%，计算机18% 。