交通与土木工程学院实验中心挂靠交通与土木工程学院，实行校、院两级管理，实行主任负责制，现由交通与土木工程学院院长兼任实验室主任，负责实验室的建设和管理工作。实验教学实行课程负责制，以课程小组为单位进行集体备课和实验教学研究。 每个分实验室实行责任人负责制，有专人负责该实验室的实验教学改革、仪器设备的管理工作。实验仪器设备专人统一管理、调配，实验器材统一采购，这一系列的措施极大地提高了中心的运转效率。

实验中心设立“助管”岗，学生利用业余时间参与实验室的日常管理、设备维护、维修，参与教师实验设备的研发和实验项目的设计，学生参与实验室工作，加强了平台与学生的联系与交流，及时了解学生的动态和需求，有利于实验教学正常开展。